恒武八年新设勘解由使，责成其严格监督新任国司与前任的交接事宜，起到整饰地方官纪的作用。另外任用有才能者为郡司，突破谱第禁区，还大力裁减编外国司郡司。

社会经济制度方面也进行了改革。桓武天皇鉴于班田收授制度在其实施上存在着一系列问题，乃将班授时间从6年一班改为12年一班，他还实行贷稻（出举稻）制和改革良贱制度，将出举稻的利率从50%降至30%；公元789年承认良贱之间通婚为合法，所生子女为“良民”。良贱制度修改是从法律上彻底取消奴隶制度的一个重要步骤。

在军制方面，由于公地公民制在瓦解，公民兵制已行不通，恒武十年桓武天皇乃废除边境以外各地的征兵制，而代之以从郡司子弟和富裕者中招募的“健儿制”。桓武朝改革使农民的债务负担和徭役负担相对地有所减轻，奴婢逐步得到解放，这应视为班田农民和奴隶长期以来进行各种形式斗争的另一成果。

可是这种改革触动了幕府，大名和贵族的利益，他们联合起来抵制天皇，并发兵讨伐，虽然最后天皇获得了胜利，可也向世人展示了天皇也不是不可以撼动。

从此以后，各地幕府将军和大名都听调不听宣，并且相互之间互相征伐，经过十几年乱战，现在东瀛岛的局势成稳了。

德川幕府控制着平安京，广岛，长崎，三郡

天皇被德川幕府控制，住在平安京，天皇已经名存实亡，政令都出不了他的皇宫，更别说出平安京了。

镰仓幕府控制了大阪，北海道，福冈三郡

室町幕府名古屋，横滨，两郡

江户幕府控制了神奈川，岗山两郡

东瀛曾经盛极一时的樱花帝国结束了，彻底进入了幕府时代，各个幕府之间相互征伐，人脑子都打成狗脑子了。